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新发地疫情新冠病毒基因序列公布,专家认为与捷克等地病毒相似

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6月19日,中央纪委国家监委网站的微信公众号发布文章,报道了中国疾控中心病毒病所针对北京新发地进行病毒检测和病毒溯源的相关工作。文中,中国疾控中心病毒病所所长助理张勇表示,“从基因组流行病学的初步研究结果看,这个病毒是从欧洲来的,但是它跟欧洲当下流行的病毒又有一定差别,它比现在欧洲流行的病毒要老。”此外,6月18日晚,中国疾控中心在“新型冠状病毒国家科技资源服务系统”上发布了2020年6月北京新发地市场新冠疫情及病毒基因组序列数据。三条数据中两条为北京市确诊病例基因组序列数据,一条为环境样本基因组序列数据。6月19日,香港大学著名病毒学专家、医学教授金冬雁告诉红星新闻记者,他查看并比对了上述三条病毒基因数据,“这三条病毒基因彼此之间只有一到两个点不一样,差异很小,说明他们来源应该是同一处。而对比世界数据来看,跟他们(三个)最像的是捷克斯洛伐克、中国台湾地区还有欧洲的一些病毒序列,差异也就一到两个核苷酸。我认为,如果想弄清楚源头的话,后续还要再查仔细点,尤其是确诊患者的流行病学情况。”中国疾控中心公布新发地新冠病毒基因序列数据三条基因数据采集时间均为6月11日6月18日晚,中国疾控中心在“新型冠状病毒国家科技资源服务系统”上发布了2020年6月北京新发地市场新冠疫情及病毒基因组序列数据。三条数据来自北京市确诊病例基因组序列数据(NMDC60013902-01、NMDC60013903-02)以及环境样本基因组序列数据(NMDC60013903-03)。中国疾病预防控制中心同时向世界卫生组织及全球共享流感数据倡议组织(GISAID)提交了新冠疫情及病毒基因组序列数据,向国际社会共享。红星新闻记者在“国家微生物科学数据中心”查看这三条基因数据后注意到,这三组基因数据的采集时间均为6月11日。也正是那天,北京在连续56天无本地报告新增确诊病例后,再次通报了一名52岁西城确诊病例。6月15日,中国疾病预防控制中心流行病学首席专家吴尊友在接受媒体采访时表示,从病毒的组成结构来看,此次病毒不像北京两个月以前出现病例的毒株,更像欧洲的。但是,欧洲毒株也并不代表病毒一定来自欧洲国家。欧洲毒株的概念是广泛的,比如对美国病毒进行分析,也显示它大部分来自欧洲毒株。俄罗斯的病例,大部分也是源于欧洲毒株,“也就是说,我们实验室的检测结果显示,毒株源于欧洲,可能来自欧洲国家,也可能来自美洲国家,这些可能都不能排除。还有待进一步收集信息来帮助判断。”此外,吴尊友强调,目前关于此次疫情源头的调查在进行当中,初步的调查结果显示,肯定不是在北京的原发地发生的,是从外部输入的,而输入的两种可能都在调查当中。武汉大学医学部的病毒学研究所教授杨占秋则告诉红星新闻记者,在他看来与其用“新老”来描述新发地病毒毒株,不如用更像哪个国家来描述,“新冠病毒在不同国家和不同地区都存在基因上的差异,所以我们或许应该看这个病毒更接近哪个国家的新冠病毒基因序列,这样会更容易找到源头。”病毒学专家分析:北京公布的基因序列与捷克、中国台湾地区等地病毒相似香港大学病毒学专家、医学教授金冬雁告诉红星新闻记者,中国疾控中心公布三条北京疫情新冠病毒基因序列后,他进行了比对和查看,将这三条基因序列对比来看,他们之间的差异很小,相差大概一到两个核苷酸。值得注意的是,差异很小并不代表没有差异。中国科学院大学遗传学博士李雷在知乎发表专栏文章指出,在北京检测到的3个病毒株并非单独一支,而是存在多支。“从当前情况来看,这3个病毒聚类在一起,那么意味着他们应该是有相似的来源。”李雷在其专栏文章中表示,该结论还可以进一步推论,早期的欧洲毒株到了中国之后开始传播,并最终在传播过程中,进化成了3个分支。而这个推论带来了一个猜测——新冠病毒有可能已经在北京默默传播了一段时间。杨占秋告诉红星新闻记者,对于上述猜测,他认为可能性几乎为零,“新冠病毒在人体内其实很难发生变异,从武汉疫情爆发到现在也就六个月的时间,无论这次在新发地爆发的新冠病毒究竟是何时进入的北京,它都不会发生非常大的变化,更别谈默默传播最终发生三种变异这种情况。”金冬雁则推测认为,他认为可能早期时欧洲毒株寄宿在了某位隐性的无症状带毒者身上,然后在社区中潜伏了一段时间以后,最终在新发地这个适合病毒传播中产生了爆发,“我始终假设存在一位‘超级传播者’,我们现在需要把这个人找出来。”“学者们说这个病毒很像欧洲的毒株,那有没有其实是同一个病毒在不同的地方发生了一样的变异呢?”对于红星新闻记者提出的问题,金冬雁表示这种现象可能性存在,但是概率比较低,“它总是会发生一些变化,而且这些变异毒株最根源的母本总会在一个地方首发,通过追踪总会追踪到。病毒有三万个核苷酸,两个新冠病毒之间的相同点、不同点经过计算都可以找到。”金冬雁指出,跟新发地病毒最像的病毒,目前仍然没有明确的结论,而经过他的比对,在当前与新发地病毒最相似的有捷克、中国台湾地区,还有欧洲的一些毒株。“所以光看病毒序列还不够,一定要结合流行病学调查。”金冬雁表示,还需要针对北京市确诊患者甚至核酸检测阳性人群进行严密的流行病学调查,搞清楚究竟是谁跟欧洲产生过联系,并将欧洲毒株带到了中国。至于为什么会在新发地这个地方爆发,金冬雁分析说,“这主要还是因为人群聚集,不知不觉中人和人的接触把病毒散播开了。另外,相比商场这种同样是人群聚集的地方,生鲜市场的卫生条件也不太好,是个更适合病毒传播的地方。”据中纪委网站,中国疾控中心病毒病所所长助理、国家流感中心副主任刘军表示,通风且干燥的环境对于病毒的传播是不利的,而湿冷且封闭的环境则相对容易导致病毒的急速扩散,“两个市场(华南海鲜市场和新发地市场)我都进去过,因为是海鲜市场,我们可以看到,它们的环境比较湿冷。而微生物包括病毒它就是怕热不怕冷,在这样的环境下能存活很久。而且这里不光是湿冷,它们还封闭,通风状况不好,这也会对病毒的传播起到推波助澜的作用。比如一个新冠病毒感染者打了一个喷嚏,它很难扩散出去,飞沫可能会沉降到地面,经过冲水扫地后污染其他地方。”(来源:红星新闻)

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